Если есть подозрение, что система повреждена сторонними системными программами, лучше пустить её под нож. Не стоит тратить время впустую, получая то тут, то там упрямые неожиданности. На этом я всё, сорри. Вникать далее в детали на системном уровне нужно только при наличии веских причин.